Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
KCNQ2O43526 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
KCNQ2O43526 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KCNQ2O43526 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
KCNQ2O43526 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
KCNQ2O43526 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms