Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DYNC1LI2O43237 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DYNC1LI2O43237 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DYNC1LI2O43237 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DYNC1LI2O43237 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DYNC1LI2O43237 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DYNC1LI2O43237 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DYNC1LI2O43237 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DYNC1LI2O43237 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DYNC1LI2O43237 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DYNC1LI2O43237 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DYNC1LI2O43237 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DYNC1LI2O43237 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms