Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PJA2O43164 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PJA2O43164 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PJA2O43164 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PJA2O43164 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PJA2O43164 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PJA2O43164 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PJA2O43164 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PJA2O43164 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PJA2O43164 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PJA2O43164 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PJA2O43164 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PJA2O43164 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PJA2O43164 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PJA2O43164 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PJA2O43164 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PJA2O43164 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PJA2O43164 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PJA2O43164 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PJA2O43164 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PJA2O43164 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PJA2O43164 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PJA2O43164 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PJA2O43164 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PJA2O43164 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PJA2O43164 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PJA2O43164 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PJA2O43164 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PJA2O43164 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PJA2O43164 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PJA2O43164 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PJA2O43164 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PJA2O43164 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PJA2O43164 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PJA2O43164 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PJA2O43164 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PJA2O43164 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PJA2O43164 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PJA2O43164 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PJA2O43164 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PJA2O43164 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PJA2O43164 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PJA2O43164 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PJA2O43164 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PJA2O43164 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PJA2O43164 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PJA2O43164 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PJA2O43164 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PJA2O43164 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PJA2O43164 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PJA2O43164 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PJA2O43164 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PJA2O43164 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PJA2O43164 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PJA2O43164 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PJA2O43164 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PJA2O43164 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PJA2O43164 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PJA2O43164 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PJA2O43164 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PJA2O43164 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PJA2O43164 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PJA2O43164 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PJA2O43164 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PJA2O43164 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PJA2O43164 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PJA2O43164 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PJA2O43164 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PJA2O43164 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PJA2O43164 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PJA2O43164 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PJA2O43164 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PJA2O43164 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PJA2O43164 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PJA2O43164 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PJA2O43164 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PJA2O43164 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PJA2O43164 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PJA2O43164 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PJA2O43164 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PJA2O43164 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PJA2O43164 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PJA2O43164 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PJA2O43164 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PJA2O43164 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PJA2O43164 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PJA2O43164 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PJA2O43164 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PJA2O43164 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PJA2O43164 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PJA2O43164 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PJA2O43164 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PJA2O43164 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PJA2O43164 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PJA2O43164 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PJA2O43164 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PJA2O43164 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PJA2O43164 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PJA2O43164 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PJA2O43164 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms