Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SpibO35906 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SpibO35906 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SpibO35906 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SpibO35906 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SpibO35906 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SpibO35906 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SpibO35906 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SpibO35906 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SpibO35906 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SpibO35906 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SpibO35906 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SpibO35906 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SpibO35906 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SpibO35906 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SpibO35906 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SpibO35906 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SpibO35906 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SpibO35906 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SpibO35906 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SpibO35906 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SpibO35906 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SpibO35906 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SpibO35906 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SpibO35906 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SpibO35906 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SpibO35906 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SpibO35906 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SpibO35906 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SpibO35906 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SpibO35906 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SpibO35906 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SpibO35906 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SpibO35906 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SpibO35906 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SpibO35906 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SpibO35906 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SpibO35906 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SpibO35906 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SpibO35906 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SpibO35906 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SpibO35906 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SpibO35906 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SpibO35906 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SpibO35906 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SpibO35906 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SpibO35906 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SpibO35906 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SpibO35906 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SpibO35906 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SpibO35906 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SpibO35906 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SpibO35906 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SpibO35906 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SpibO35906 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SpibO35906 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SpibO35906 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SpibO35906 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SpibO35906 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SpibO35906 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SpibO35906 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SpibO35906 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SpibO35906 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SpibO35906 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SpibO35906 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SpibO35906 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SpibO35906 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SpibO35906 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SpibO35906 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SpibO35906 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SpibO35906 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SpibO35906 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SpibO35906 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SpibO35906 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SpibO35906 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SpibO35906 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SpibO35906 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SpibO35906 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SpibO35906 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SpibO35906 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SpibO35906 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SpibO35906 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SpibO35906 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SpibO35906 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SpibO35906 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SpibO35906 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SpibO35906 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SpibO35906 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SpibO35906 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SpibO35906 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SpibO35906 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SpibO35906 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SpibO35906 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SpibO35906 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SpibO35906 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SpibO35906 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SpibO35906 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SpibO35906 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SpibO35906 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SpibO35906 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms