Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phox2bO35690 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phox2bO35690 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phox2bO35690 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phox2bO35690 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phox2bO35690 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms