Protein–RNA interactions for Protein: O35459

Ech1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ech1O35459 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ech1O35459 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ech1O35459 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ech1O35459 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ech1O35459 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ech1O35459 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ech1O35459 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ech1O35459 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ech1O35459 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ech1O35459 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ech1O35459 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ech1O35459 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ech1O35459 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ech1O35459 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ech1O35459 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ech1O35459 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ech1O35459 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ech1O35459 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ech1O35459 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ech1O35459 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ech1O35459 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ech1O35459 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ech1O35459 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ech1O35459 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ech1O35459 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ech1O35459 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ech1O35459 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ech1O35459 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ech1O35459 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ech1O35459 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ech1O35459 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ech1O35459 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ech1O35459 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ech1O35459 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ech1O35459 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ech1O35459 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ech1O35459 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ech1O35459 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ech1O35459 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ech1O35459 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ech1O35459 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ech1O35459 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ech1O35459 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ech1O35459 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ech1O35459 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms