Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf5O35445 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf5O35445 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf5O35445 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf5O35445 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms