Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEFVO15553 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEFVO15553 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
MEFVO15553 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEFVO15553 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEFVO15553 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEFVO15553 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEFVO15553 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEFVO15553 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEFVO15553 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEFVO15553 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEFVO15553 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEFVO15553 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEFVO15553 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEFVO15553 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MEFVO15553 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEFVO15553 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEFVO15553 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEFVO15553 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEFVO15553 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEFVO15553 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEFVO15553 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEFVO15553 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEFVO15553 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEFVO15553 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MEFVO15553 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEFVO15553 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEFVO15553 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEFVO15553 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEFVO15553 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEFVO15553 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEFVO15553 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEFVO15553 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEFVO15553 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEFVO15553 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEFVO15553 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEFVO15553 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEFVO15553 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEFVO15553 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEFVO15553 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEFVO15553 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEFVO15553 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEFVO15553 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEFVO15553 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEFVO15553 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEFVO15553 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEFVO15553 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEFVO15553 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEFVO15553 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MEFVO15553 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEFVO15553 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEFVO15553 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEFVO15553 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEFVO15553 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEFVO15553 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEFVO15553 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEFVO15553 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEFVO15553 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEFVO15553 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEFVO15553 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEFVO15553 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEFVO15553 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEFVO15553 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEFVO15553 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEFVO15553 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEFVO15553 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEFVO15553 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEFVO15553 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEFVO15553 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEFVO15553 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEFVO15553 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEFVO15553 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEFVO15553 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MEFVO15553 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEFVO15553 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MEFVO15553 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEFVO15553 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MEFVO15553 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MEFVO15553 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEFVO15553 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEFVO15553 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEFVO15553 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MEFVO15553 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MEFVO15553 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
MEFVO15553 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEFVO15553 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MEFVO15553 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MEFVO15553 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MEFVO15553 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEFVO15553 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEFVO15553 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEFVO15553 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEFVO15553 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEFVO15553 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEFVO15553 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEFVO15553 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEFVO15553 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEFVO15553 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MEFVO15553 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEFVO15553 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms