Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTLC1O15269 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTLC1O15269 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTLC1O15269 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTLC1O15269 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTLC1O15269 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTLC1O15269 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTLC1O15269 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPTLC1O15269 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPTLC1O15269 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPTLC1O15269 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPTLC1O15269 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPTLC1O15269 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPTLC1O15269 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPTLC1O15269 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTLC1O15269 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC1O15269 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms