Protein–RNA interactions for Protein: O15266

SHOX, Short stature homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOXO15266 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOXO15266 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOXO15266 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOXO15266 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOXO15266 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOXO15266 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHOXO15266 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOXO15266 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOXO15266 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOXO15266 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHOXO15266 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHOXO15266 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHOXO15266 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHOXO15266 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHOXO15266 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOXO15266 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHOXO15266 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOXO15266 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHOXO15266 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOXO15266 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOXO15266 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOXO15266 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOXO15266 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOXO15266 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHOXO15266 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOXO15266 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOXO15266 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOXO15266 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHOXO15266 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOXO15266 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOXO15266 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOXO15266 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOXO15266 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHOXO15266 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOXO15266 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOXO15266 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOXO15266 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOXO15266 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOXO15266 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHOXO15266 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHOXO15266 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHOXO15266 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHOXO15266 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHOXO15266 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHOXO15266 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHOXO15266 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHOXO15266 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHOXO15266 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHOXO15266 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHOXO15266 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOXO15266 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHOXO15266 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOXO15266 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SHOXO15266 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOXO15266 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOXO15266 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOXO15266 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHOXO15266 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOXO15266 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOXO15266 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOXO15266 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOXO15266 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOXO15266 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SHOXO15266 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHOXO15266 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOXO15266 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOXO15266 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHOXO15266 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOXO15266 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHOXO15266 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SHOXO15266 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHOXO15266 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SHOXO15266 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHOXO15266 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHOXO15266 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SHOXO15266 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHOXO15266 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SHOXO15266 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SHOXO15266 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOXO15266 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOXO15266 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOXO15266 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOXO15266 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOXO15266 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOXO15266 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOXO15266 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHOXO15266 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOXO15266 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOXO15266 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOXO15266 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOXO15266 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOXO15266 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHOXO15266 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHOXO15266 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SHOXO15266 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOXO15266 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOXO15266 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOXO15266 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOXO15266 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SHOXO15266 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms