Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACOX3O15254 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACOX3O15254 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACOX3O15254 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACOX3O15254 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACOX3O15254 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACOX3O15254 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACOX3O15254 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACOX3O15254 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACOX3O15254 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACOX3O15254 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms