Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLGNO14967 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLGNO14967 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLGNO14967 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLGNO14967 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLGNO14967 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLGNO14967 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLGNO14967 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLGNO14967 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLGNO14967 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLGNO14967 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLGNO14967 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLGNO14967 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLGNO14967 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLGNO14967 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLGNO14967 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLGNO14967 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLGNO14967 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLGNO14967 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLGNO14967 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLGNO14967 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLGNO14967 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLGNO14967 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLGNO14967 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLGNO14967 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLGNO14967 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLGNO14967 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLGNO14967 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLGNO14967 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLGNO14967 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLGNO14967 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLGNO14967 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLGNO14967 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLGNO14967 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLGNO14967 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLGNO14967 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLGNO14967 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLGNO14967 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLGNO14967 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLGNO14967 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLGNO14967 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLGNO14967 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLGNO14967 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLGNO14967 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLGNO14967 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLGNO14967 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLGNO14967 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLGNO14967 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLGNO14967 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLGNO14967 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLGNO14967 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLGNO14967 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLGNO14967 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLGNO14967 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLGNO14967 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLGNO14967 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLGNO14967 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLGNO14967 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLGNO14967 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLGNO14967 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLGNO14967 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLGNO14967 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLGNO14967 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLGNO14967 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLGNO14967 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLGNO14967 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLGNO14967 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLGNO14967 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLGNO14967 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLGNO14967 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLGNO14967 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLGNO14967 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLGNO14967 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLGNO14967 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLGNO14967 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLGNO14967 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLGNO14967 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLGNO14967 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLGNO14967 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLGNO14967 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLGNO14967 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLGNO14967 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLGNO14967 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLGNO14967 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLGNO14967 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLGNO14967 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLGNO14967 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLGNO14967 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLGNO14967 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLGNO14967 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLGNO14967 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLGNO14967 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLGNO14967 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLGNO14967 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLGNO14967 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLGNO14967 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLGNO14967 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLGNO14967 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLGNO14967 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLGNO14967 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms