Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IKBKBO14920 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IKBKBO14920 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IKBKBO14920 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IKBKBO14920 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms