Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIN7AO14910 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIN7AO14910 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LIN7AO14910 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIN7AO14910 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms