Protein–RNA interactions for Protein: O14497

ARID1A, AT-rich interactive domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 2,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1AO14497 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID1AO14497 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1AO14497 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID1AO14497 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARID1AO14497 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID1AO14497 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID1AO14497 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID1AO14497 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARID1AO14497 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID1AO14497 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID1AO14497 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID1AO14497 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARID1AO14497 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms