Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac1O09106 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac1O09106 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac1O09106 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac1O09106 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac1O09106 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac1O09106 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac1O09106 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac1O09106 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac1O09106 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac1O09106 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hdac1O09106 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac1O09106 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac1O09106 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac1O09106 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac1O09106 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac1O09106 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac1O09106 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac1O09106 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac1O09106 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac1O09106 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac1O09106 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac1O09106 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Hdac1O09106 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac1O09106 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac1O09106 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac1O09106 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac1O09106 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac1O09106 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac1O09106 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac1O09106 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac1O09106 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac1O09106 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac1O09106 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac1O09106 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac1O09106 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hdac1O09106 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac1O09106 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hdac1O09106 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac1O09106 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hdac1O09106 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac1O09106 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac1O09106 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac1O09106 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac1O09106 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac1O09106 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms