Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Eftud2O08810 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Eftud2O08810 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eftud2O08810 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eftud2O08810 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Eftud2O08810 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms