Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sec22bO08547 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec22bO08547 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec22bO08547 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec22bO08547 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec22bO08547 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec22bO08547 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec22bO08547 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec22bO08547 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec22bO08547 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec22bO08547 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec22bO08547 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec22bO08547 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec22bO08547 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec22bO08547 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms