Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
U90926O08546 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
U90926O08546 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U90926O08546 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
U90926O08546 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
U90926O08546 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
U90926O08546 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
U90926O08546 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
U90926O08546 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U90926O08546 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U90926O08546 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U90926O08546 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U90926O08546 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U90926O08546 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U90926O08546 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U90926O08546 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U90926O08546 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U90926O08546 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
U90926O08546 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U90926O08546 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U90926O08546 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U90926O08546 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
U90926O08546 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U90926O08546 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U90926O08546 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U90926O08546 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U90926O08546 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U90926O08546 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U90926O08546 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U90926O08546 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U90926O08546 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U90926O08546 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U90926O08546 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U90926O08546 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U90926O08546 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U90926O08546 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U90926O08546 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
U90926O08546 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
U90926O08546 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
U90926O08546 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
U90926O08546 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
U90926O08546 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
U90926O08546 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
U90926O08546 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
U90926O08546 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U90926O08546 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U90926O08546 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U90926O08546 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U90926O08546 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U90926O08546 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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