Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PIK3C2BO00750 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PIK3C2BO00750 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PIK3C2BO00750 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PIK3C2BO00750 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PIK3C2BO00750 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PIK3C2BO00750 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
PIK3C2BO00750 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PIK3C2BO00750 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PIK3C2BO00750 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PIK3C2BO00750 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PIK3C2BO00750 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PIK3C2BO00750 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PIK3C2BO00750 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PIK3C2BO00750 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PIK3C2BO00750 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PIK3C2BO00750 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PIK3C2BO00750 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PIK3C2BO00750 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PIK3C2BO00750 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PIK3C2BO00750 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PIK3C2BO00750 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PIK3C2BO00750 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
PIK3C2BO00750 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PIK3C2BO00750 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PIK3C2BO00750 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PIK3C2BO00750 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PIK3C2BO00750 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PIK3C2BO00750 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms