Protein–RNA interactions for Protein: O00634

NTN3, Netrin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3O00634 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTN3O00634 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTN3O00634 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTN3O00634 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTN3O00634 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTN3O00634 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTN3O00634 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTN3O00634 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTN3O00634 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTN3O00634 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTN3O00634 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTN3O00634 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTN3O00634 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTN3O00634 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NTN3O00634 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTN3O00634 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTN3O00634 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTN3O00634 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTN3O00634 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTN3O00634 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTN3O00634 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTN3O00634 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTN3O00634 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NTN3O00634 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTN3O00634 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTN3O00634 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTN3O00634 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTN3O00634 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTN3O00634 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTN3O00634 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTN3O00634 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTN3O00634 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTN3O00634 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTN3O00634 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTN3O00634 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTN3O00634 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTN3O00634 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTN3O00634 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTN3O00634 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTN3O00634 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTN3O00634 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTN3O00634 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTN3O00634 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NTN3O00634 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTN3O00634 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTN3O00634 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTN3O00634 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NTN3O00634 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTN3O00634 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTN3O00634 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTN3O00634 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTN3O00634 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTN3O00634 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTN3O00634 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTN3O00634 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTN3O00634 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTN3O00634 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTN3O00634 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTN3O00634 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NTN3O00634 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NTN3O00634 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NTN3O00634 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NTN3O00634 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NTN3O00634 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTN3O00634 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTN3O00634 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTN3O00634 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTN3O00634 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTN3O00634 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NTN3O00634 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTN3O00634 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTN3O00634 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NTN3O00634 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTN3O00634 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTN3O00634 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTN3O00634 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTN3O00634 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTN3O00634 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTN3O00634 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTN3O00634 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTN3O00634 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTN3O00634 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTN3O00634 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTN3O00634 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTN3O00634 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTN3O00634 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NTN3O00634 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTN3O00634 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NTN3O00634 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTN3O00634 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NTN3O00634 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTN3O00634 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NTN3O00634 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTN3O00634 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTN3O00634 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTN3O00634 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTN3O00634 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NTN3O00634 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NTN3O00634 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NTN3O00634 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms