Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PIK3C2AO00443 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PIK3C2AO00443 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PIK3C2AO00443 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PIK3C2AO00443 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PIK3C2AO00443 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PIK3C2AO00443 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
PIK3C2AO00443 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PIK3C2AO00443 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PIK3C2AO00443 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PIK3C2AO00443 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PIK3C2AO00443 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PIK3C2AO00443 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PIK3C2AO00443 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PIK3C2AO00443 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PIK3C2AO00443 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PIK3C2AO00443 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PIK3C2AO00443 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PIK3C2AO00443 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PIK3C2AO00443 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PIK3C2AO00443 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PIK3C2AO00443 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms