Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3FO00303 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3FO00303 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3FO00303 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3FO00303 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.1 ms