Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGPSO00116 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGPSO00116 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGPSO00116 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGPSO00116 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AGPSO00116 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AGPSO00116 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AGPSO00116 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AGPSO00116 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AGPSO00116 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AGPSO00116 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGPSO00116 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AGPSO00116 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGPSO00116 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGPSO00116 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGPSO00116 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGPSO00116 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGPSO00116 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGPSO00116 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGPSO00116 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGPSO00116 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGPSO00116 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGPSO00116 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGPSO00116 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
AGPSO00116 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGPSO00116 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGPSO00116 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGPSO00116 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGPSO00116 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGPSO00116 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGPSO00116 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPSO00116 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGPSO00116 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AGPSO00116 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
AGPSO00116 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGPSO00116 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
AGPSO00116 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGPSO00116 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGPSO00116 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGPSO00116 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGPSO00116 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGPSO00116 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGPSO00116 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGPSO00116 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGPSO00116 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGPSO00116 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGPSO00116 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGPSO00116 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGPSO00116 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGPSO00116 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGPSO00116 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
AGPSO00116 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGPSO00116 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGPSO00116 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGPSO00116 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGPSO00116 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGPSO00116 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AGPSO00116 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGPSO00116 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGPSO00116 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGPSO00116 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGPSO00116 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGPSO00116 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGPSO00116 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGPSO00116 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGPSO00116 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGPSO00116 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGPSO00116 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGPSO00116 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGPSO00116 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGPSO00116 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGPSO00116 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGPSO00116 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AGPSO00116 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGPSO00116 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGPSO00116 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26■■□□□ 1.75
AGPSO00116 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGPSO00116 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGPSO00116 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGPSO00116 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGPSO00116 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGPSO00116 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGPSO00116 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGPSO00116 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGPSO00116 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGPSO00116 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPSO00116 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPSO00116 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPSO00116 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPSO00116 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGPSO00116 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGPSO00116 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGPSO00116 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGPSO00116 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGPSO00116 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGPSO00116 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGPSO00116 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGPSO00116 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGPSO00116 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGPSO00116 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms