Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp35M0QWN7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp35M0QWN7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp35M0QWN7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp35M0QWN7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp35M0QWN7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms