Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3488M0QW81 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3488M0QW81 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3488M0QW81 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3488M0QW81 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3488M0QW81 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3488M0QW81 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3488M0QW81 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3488M0QW81 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3488M0QW81 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3488M0QW81 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3488M0QW81 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3488M0QW81 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3488M0QW81 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3488M0QW81 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3488M0QW81 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3488M0QW81 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms