Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm20878L7N244 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20878L7N244 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20878L7N244 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20878L7N244 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm20878L7N244 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20878L7N244 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20878L7N244 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20878L7N244 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20878L7N244 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20878L7N244 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20878L7N244 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20878L7N244 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20878L7N244 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20878L7N244 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20878L7N244 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20878L7N244 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms