Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm2888K7N746 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm2888K7N746 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm2888K7N746 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm2888K7N746 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2888K7N746 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2888K7N746 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2888K7N746 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2888K7N746 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2888K7N746 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2888K7N746 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2888K7N746 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2888K7N746 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2888K7N746 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2888K7N746 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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