Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccer2J3QPU5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccer2J3QPU5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccer2J3QPU5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccer2J3QPU5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ccer2J3QPU5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Ccer2J3QPU5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccer2J3QPU5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms