Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21798J3QNU5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm21798J3QNU5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21798J3QNU5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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