Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim18J3QNP2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim18J3QNP2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smim18J3QNP2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smim18J3QNP2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smim18J3QNP2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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