Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW5

Gm2075, Predicted gene 2075, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2075J3QMW5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2075J3QMW5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2075J3QMW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2075J3QMW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2075J3QMW5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm2075J3QMW5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2075J3QMW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm2075J3QMW5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm2075J3QMW5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm2075J3QMW5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm2075J3QMW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm2075J3QMW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm2075J3QMW5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2075J3QMW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2075J3QMW5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2075J3QMW5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2075J3QMW5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2075J3QMW5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2075J3QMW5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2075J3QMW5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2075J3QMW5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms