Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28051J3QMA2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28051J3QMA2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28051J3QMA2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm28051J3QMA2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28051J3QMA2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms