Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm21897J3KMP5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm21897J3KMP5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21897J3KMP5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21897J3KMP5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21897J3KMP5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21897J3KMP5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm21897J3KMP5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm21897J3KMP5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21897J3KMP5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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