Protein–RNA interactions for Protein: H8Y6P7

GCOM1, GRINL1A combined protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1H8Y6P7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCOM1H8Y6P7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCOM1H8Y6P7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GCOM1H8Y6P7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCOM1H8Y6P7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GCOM1H8Y6P7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GCOM1H8Y6P7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCOM1H8Y6P7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCOM1H8Y6P7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCOM1H8Y6P7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCOM1H8Y6P7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GCOM1H8Y6P7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms