Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
CROCC2H7BZ55 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CROCC2H7BZ55 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CROCC2H7BZ55 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CROCC2H7BZ55 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CROCC2H7BZ55 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CROCC2H7BZ55 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms