Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Arfgef1G3X9K3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arfgef1G3X9K3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arfgef1G3X9K3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arfgef1G3X9K3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Arfgef1G3X9K3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Arfgef1G3X9K3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arfgef1G3X9K3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Arfgef1G3X9K3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Arfgef1G3X9K3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Arfgef1G3X9K3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Arfgef1G3X9K3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Arfgef1G3X9K3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Arfgef1G3X9K3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Arfgef1G3X9K3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms