Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ScaperF8VQ70 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ScaperF8VQ70 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ScaperF8VQ70 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ScaperF8VQ70 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ScaperF8VQ70 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ScaperF8VQ70 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ScaperF8VQ70 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ScaperF8VQ70 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ScaperF8VQ70 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ScaperF8VQ70 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ScaperF8VQ70 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ScaperF8VQ70 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ScaperF8VQ70 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ScaperF8VQ70 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ScaperF8VQ70 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ScaperF8VQ70 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ScaperF8VQ70 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ScaperF8VQ70 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ScaperF8VQ70 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ScaperF8VQ70 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
ScaperF8VQ70 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ScaperF8VQ70 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ScaperF8VQ70 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ScaperF8VQ70 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ScaperF8VQ70 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ScaperF8VQ70 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ScaperF8VQ70 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ScaperF8VQ70 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ScaperF8VQ70 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ScaperF8VQ70 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ScaperF8VQ70 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ScaperF8VQ70 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ScaperF8VQ70 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms