Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28048F7BCN0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28048F7BCN0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm28048F7BCN0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm28048F7BCN0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28048F7BCN0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms