Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhox13F6YCR7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhox13F6YCR7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rhox13F6YCR7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhox13F6YCR7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox13F6YCR7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox13F6YCR7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms