Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atf6F6VAN0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf6F6VAN0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf6F6VAN0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf6F6VAN0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf6F6VAN0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atf6F6VAN0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atf6F6VAN0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf6F6VAN0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf6F6VAN0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf6F6VAN0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf6F6VAN0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf6F6VAN0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf6F6VAN0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atf6F6VAN0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atf6F6VAN0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf6F6VAN0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf6F6VAN0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms