Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pagr1bF6V0H0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pagr1bF6V0H0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pagr1bF6V0H0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pagr1bF6V0H0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pagr1bF6V0H0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pagr1bF6V0H0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pagr1bF6V0H0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pagr1bF6V0H0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pagr1bF6V0H0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pagr1bF6V0H0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Pagr1bF6V0H0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pagr1bF6V0H0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pagr1bF6V0H0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pagr1bF6V0H0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pagr1bF6V0H0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pagr1bF6V0H0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pagr1bF6V0H0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms