Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28305F6U473 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28305F6U473 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28305F6U473 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28305F6U473 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms