Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm10477F6SW83 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm10477F6SW83 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm10477F6SW83 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm10477F6SW83 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm10477F6SW83 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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