Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Syngap1F6SEU4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syngap1F6SEU4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syngap1F6SEU4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syngap1F6SEU4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syngap1F6SEU4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syngap1F6SEU4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms