Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa27F2Z403 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa27F2Z403 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa27F2Z403 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa27F2Z403 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms