Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
2610001J05RikF2Z3Y9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
2610001J05RikF2Z3Y9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.6 ms