Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Raph1F2Z3U3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Raph1F2Z3U3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Raph1F2Z3U3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Raph1F2Z3U3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms