Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc146E9Q9F7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc146E9Q9F7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc146E9Q9F7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc146E9Q9F7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc146E9Q9F7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc146E9Q9F7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc146E9Q9F7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc146E9Q9F7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc146E9Q9F7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc146E9Q9F7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc146E9Q9F7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc146E9Q9F7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc146E9Q9F7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms