Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mcmdc2E9Q956 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mcmdc2E9Q956 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Mcmdc2E9Q956 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mcmdc2E9Q956 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mcmdc2E9Q956 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mcmdc2E9Q956 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mcmdc2E9Q956 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mcmdc2E9Q956 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mcmdc2E9Q956 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mcmdc2E9Q956 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mcmdc2E9Q956 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mcmdc2E9Q956 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mcmdc2E9Q956 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mcmdc2E9Q956 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mcmdc2E9Q956 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mcmdc2E9Q956 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mcmdc2E9Q956 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mcmdc2E9Q956 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mcmdc2E9Q956 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mcmdc2E9Q956 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mcmdc2E9Q956 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms